Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pde6cQ91ZQ1 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms