Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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