Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rmi2Q3UPE3 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms