Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Rnf180Q3U827 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rnf180Q3U827 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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