Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms