Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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Ttc39dQ0VF76 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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Ttc39dQ0VF76 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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Ttc39dQ0VF76 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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Ttc39dQ0VF76 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ttc39dQ0VF76 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ttc39dQ0VF76 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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Ttc39dQ0VF76 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ttc39dQ0VF76 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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Ttc39dQ0VF76 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ttc39dQ0VF76 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ttc39dQ0VF76 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ttc39dQ0VF76 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ttc39dQ0VF76 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ttc39dQ0VF76 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ttc39dQ0VF76 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ttc39dQ0VF76 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ttc39dQ0VF76 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms