Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ttc21bQ0HA38 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ttc21bQ0HA38 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms