Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sh3bp2Q06649 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sh3bp2Q06649 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sh3bp2Q06649 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sh3bp2Q06649 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Sh3bp2Q06649 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sh3bp2Q06649 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms