Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd13P70217 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms