Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Sh3bp1P55194 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Sh3bp1P55194 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Sh3bp1P55194 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sh3bp1P55194 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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