Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprkP35822 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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