Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Hoxd10P28359 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms