Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
P10404 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
P10404 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
P10404 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms