Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms