Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Gm379J3QQ19 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Gm379J3QQ19 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms