Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm24062-201ENSMUST00000157490 266 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm25551-201ENSMUST00000158082 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm45227-201ENSMUST00000205585 169 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Tubb3-202ENSMUST00000212743 776 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Gm21887J3QQ04 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm24794-201ENSMUST00000104288 140 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Gm21887J3QQ04 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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