Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm3550W4VSN7 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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