Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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