Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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