Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms