Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms