Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms