Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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