Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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ptchd1Q14B62 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms