Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Prim1P20664 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Prim1P20664 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prim1P20664 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prim1P20664 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prim1P20664 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prim1P20664 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prim1P20664 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Prim1P20664 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prim1P20664 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Prim1P20664 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms