Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb1P17919 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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