Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Spta1P08032 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Spta1P08032 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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