Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Pdzd2E9Q1M1 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Pdzd2E9Q1M1 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
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Pdzd2E9Q1M1 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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Pdzd2E9Q1M1 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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Pdzd2E9Q1M1 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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Pdzd2E9Q1M1 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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Pdzd2E9Q1M1 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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Pdzd2E9Q1M1 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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Pdzd2E9Q1M1 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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Pdzd2E9Q1M1 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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Pdzd2E9Q1M1 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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