Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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