Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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Col5a3Q9JLI2 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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Col5a3Q9JLI2 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Col5a3Q9JLI2 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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Col5a3Q9JLI2 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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Col5a3Q9JLI2 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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Col5a3Q9JLI2 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col5a3Q9JLI2 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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