Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RpainQ9CWY9 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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