Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Vipas39Q8BGQ1 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Vipas39Q8BGQ1 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms