Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms