Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rbbp4Q60972 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Rbbp4Q60972 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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Rbbp4Q60972 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Rbbp4Q60972 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms