Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Sh3bp2Q06649 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp2Q06649 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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