Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Sh3bp1P55194 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Sh3bp1P55194 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms