Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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