Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PtpraP18052 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms