Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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Ccl20O89093 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ccl20O89093 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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