Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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Pdzd2E9Q1M1 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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Pdzd2E9Q1M1 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Pdzd2E9Q1M1 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Pdzd2E9Q1M1 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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