Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ccdc6D3YZP9 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms