Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Rabgef1Q9JM13 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rabgef1Q9JM13 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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