Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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Zbed3Q9D0L1 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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