Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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