Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms