Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc18Q640L5 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms