Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rpusd2Q149F1 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rpusd2Q149F1 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms