Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sh3bp1P55194 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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Sh3bp1P55194 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sh3bp1P55194 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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