Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd9P28357 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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