Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Tgfb1P04202 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms